Bioenergetik

Oksidasi Biologi

Biokimia dan Biologi Molekular

Univ. Tarumanagara

Pendahuluan
Bioenergetika merupakan ilmu pengetahuan
tentang perubahan energi yang menyertai
reaksi biokimia.
Ilmu ini memberikan dasar utk menjelaskan
mengapa sebagian reaksi terjadi dan lainnya
tidak.
Sistem biologik pada hakekatnya bersifat
isotermik dan memakai energi kimia utk
memberikan tenaga kehidupan.
Sistem biologik mengikuti kaidah umum
termodinamik.

First law of thermodynamics:

For any chemical or physical change the total energy of
the universe remains constant, in other words, energy
may change form, or transported from one place to other
but it cannot be destroyed or created.
Second law of thermodynamics:
Any spontaneous chemical or physical change is always
accompanied by increase in the disorder of the universe.
In other words disorder or entropy of the universe
increases in all natural processes.

Energy in chemical reactions:

Free energy (G): It is an amount of energy capable of doing work
during a reaction at constant temperature and pressure. When a
reaction proceeds with release of free energy, the free energy
change G has a negative value and the reaction is called exergonic.
Opposite is endergonic reaction in which there is gain of free energy.

Enthalpy (H): Represents the heat content of the reacting

systems. When there is release of heat during a reaction it is
referred as exothermic reaction and the H is negative. Opposite is
endothermic reaction with H positive.

Entropy (S): it is a quantitative expression for the randomness or

disorder in the system. There is always an increase in entropy or
gain of entropy of the overall system in any reaction, i.e S is always
+ve.
G = H - TS

Free energy of a reaction

The free energy change (G) of a reaction
determines its spontaneity. A reaction is
spontaneous if G is negative (if the free energy
of products is less than that of reactants).

For a reaction A + B C + D
G =

Go'

[C] [D]
+ RT ln
[A] [B]

Go' = standard free energy change (at pH 7, 1M

reactants & products); R = gas constant; T = temp.

 G may be larger or smaller than G0,

depending on cellular concentrations of
reactants and products.

Energy coupling
A spontaneous reaction may drive a nonspontaneous reaction.
For example, in the reaction catalyzed by the Glycolysis
enzyme Hexokinase, the half-reactions are:
ATP + H2O ADP + Pi

Go' = 31 kJ/mol

Pi + glucose glucose-6-P + H2O

Go' = +14 kJ/mol

Coupled reaction:
ATP + glucose ADP + glucose-6-P Go' = 17 kJ/mol

Coupled Reactions

Perangkaian reaksi
endergonik - eksergonik

Pengalihan energi bebas melalui

senyawa antara energi tinggi

Biochemical Pathways
Biochemical pathways are the organizational units of
metabolism.
Metabolism is the total of all chemical reactions
carried out by an organism.
anabolism - reactions that expend energy
catabolism - reactions that harvest energy

ATP
Adenosine triphosphate (ATP) is the chief energy
currency of the cell.
Each molecule is a nucleotide composed of
ribose, adenine, and a triphosphate group.
energy stored in the triphosphate group
cell uses ATP to drive endergonic reactions

Senyawa berenergi tinggi

Asetil- Co A
Asil-carrier protein
S- adenosil metionin ( metionin aktif )
UDPGlc(uridin difosfatglukosa)
PRPP(5-fosforibosil-1-pirofosfat)

 Terdapat 3 sumber utama fosfat yg ikut

dalam konsentrasi energi atau
penangkapan energi:
Fosforilasi oksidatif:sumber ~P terbanyak dlm
organisme aerob.
Glikolisis
Siklus asam sitrat

 Fosfagen : berfungsi sbg btk simpanan

fosfat berenergi tinggi. Berupa Kreatin
fosfat, yg terdapat di otot rangka, jantung,
spermatozoa, dan otak.

Siklus ATP/ADP

Oksidasi Biologi
1. Oksidasi : kehilangan elektron dan selalui
disertai reduksi senyawa lain yang menerima
elektron.
2. Oksidasi : kehilangan hidrogen atau
dehidrogenasi
3. Oksidasi : mendapat oksigen

Enzim Oksidoreduktase
Enzim ini dikelompokkan dalam 4 kelompok:
1. Oksidase
2. dehidrogenase, aerobik & anaerobik
3. hidroperoksidase
4. Oksigenase

Oksidase
Oksidase: menggunakan oksigen sebagai
akseptor hidrogen
Oksidase bekerja mengambil hidrogen dari
substrat menggunakan oksigen sebagai
akseptor hidrogen. Hasil kerjanya ialah air atau
hidrogen peroksida.

Contoh
Sitokrom oksidase (mengandung Cu)
flavoprotein (mengandung FMN atau FAD)
Xanthine oksidase (mengandung Mo)

Dehidrogenase
Dehidrogenase: tidak menggunakan oksigen
sebagai akseptor hidrogen
DH menunjukkan 2 fungsi utama
1. Memindahkan hidrogen dari satu substrat ke
substrat lain pada reaksi oksidasi reduksi.
Umumnya menggunakan koenzim NAD+
Reaksi ini tidak melibatkan oksigen, terjadi
pada glikolisis anaerobik.

2.

DH yang
pernafasan

merupakan

komponen

rantai

DH dengan koenzim nikotinamide

- DH dengan NAD mengkatalisis reaksi
oksidoreduktase, terutama glikolisis, siklus
asam sitrat dan rantai pernafasan
- DH dengan NADP bekerja pada sintesis
dengan reduksi seperti sintesis asam lemak
extramitokondria dan sintesis steroid

 DH dengan koenzim riboflavin bekerja pada

transport elektron dalam atau ke rantai
pernafasan.
Sitokrom dapat juga dianggap sebagai DH
Sitokrom adalah hemoprotein yang
mengandung besi Fe
Pada RP sitokrom bekerja sebagai carrier
elektron antara flavoprotein dan sitokrom
oksidase

Hidroperoksidase
Hidroperoksidase menggunakan H2O2 atau
peroksida organik sebagai substrat
Ada 2 jenis
peroksidase
Katalase

 Peroksidase yang mereduksi peroksida

terdapat dalam leukosit, platelet
Peroksidase akan memakai hidrogen peroksida
dengan senyawa-senyawa seperti asam
askorbat, quinon, sit. c sebagai akseptor
elektron.

 Di dalam eritrosit dan jaringan lain enzim

gluthione peroksidase yang mengandung
selenium sebagai gugus prostetik, bekerja
memecah H2O2 dan hidroperoksidase lipid
menggunakan reduced glutathione (G-SH),
sehingga dapat melindungi lipid membran dan
hemoglobin terhadap oksidasi oleh H2O2

 Katalase dengan substrat H2O2 sebagai donor

dan akseptor elektron
Katalase merupakan hemoprotein mengandung
4 gugus heme. Katalase bekerja memecah 2
mol H2O2, satu molekul sebagai substrat donor
elektron dan satu molekul lagi sebagai oksidan
atau akseptor elektron.

 Katalase terdapat di darah, sumsum tulang,

membrane mucous, ginjal dan hepar. Fungsinya
adalah memecah H2O2 yang dibentuk oleh
oxidase.
Peroksisome terdapat dalam banyak jaringan
termasuk hepar, kaya akan oksidase dan
katalase. Jadi enzim yang menghasilkan H2O2
disediakan juga enzim yang memecah H2O2

Oksigenase
Oksigenase langsung mentransfer dan
menempatkan oksigen ke molekul substrat.
Oksigenase terlibat pada sintesis dan
pemecahan bermacam-macam jenis metabolit.
(a) Dioksigenase yang menempatkan kedua
oksigen ke substrat

(b) Monooxygenase
Menempatkan hanya satu atom oksigen ke
molekul substrat.
Atom oksigen lainnya direduksi menjadi H2O,
perlu tambahan donor elektron atau ko substrat
(Z)

(c) Sitokrom P450 merupakan monooxygenase

untuk detoksifikasi obat-obat dan hidroksilasi
steroid.

Superoksida Dismutase
Superoxida Dismutase bekerja melindungi
organisme aerobik terhadap toxisitas oksigen.
Oksigen sebenarnya toksik, bukan karena dapat
membentuk H2O2 tetapi dapat direduksi oleh
jaringan membentuk superoxide anion free
radical (O2-)

Thank You