ASAM AMINO,

PROTEIN
&
ASAM NUKLEAT
Kuliah Biomedik 1
Fakultas Kedokteran
Universitas Tarumanagara

MAKANAN NORMAL

campuran kompleks
bahan-bahan tumbuhan dan
binatang
PROTEIN, LEMAK,
KARBOHIDRAT

DEFINISI
PROTEIN PROTEIOS
Il
Pertama
POLIAMIDA
Asam-asam amino = 20
macam

STRUKTUR UMUM
O
H2N

CH C

OH

R
O
H2N

H3N

CH C
R

OH

CH
R

C
O

ION
DIPOLAR
ZWITTER
ION

RANTAI SAMPING
R = alifatik
gly, ala, val,
leu, ile, pro
R = hidrosiklik ser, thr
R = aromatik phe, tyr, trp
R = asam
asp, glu
R = amida
asn, gln
R = basa
lys, arg, his
R = mengand. S cys, met

Contoh:
Alani
ala
A

O
H2N

CH

C
OH

CH3
Fenil
Alanin
phe
F

NH2
H2
C

CH

O
C
OH

KONFIGURASI
COOH

CHO
HO

CH OH
2
L-Gliseraldehid

..

H 2N

R
asam L-amino

Titik isoelektrik
R

H
C
NH3

COOH
+

OH
H

H
C
NH3

COO
+

O HH+

H
C

COO

NH2

Jadi pI = ( pK kiri + pK kanan)

ALANIN = ALA
H
C

CH3

NH3

CH3

H
C
NH3

COO

pKb = 9,7

COOH
+

pKa = 2,3

OH
H

CH3

H
C
NH3

2,3
+1

COO
+

OH
+
H

CH3

H
C
NH2

9,7
0

pI = ( 2,3 + 9,7) = 6

-1

COO

 pI = ( 2,2 + 4,3) = 3,25

Lysin = LYS
pKa = 2,2 ; pKb= 9,0; pKR=
10,5

Asam glutamat
-

CO2 CH2 CH2 CH

NH3

CO2
+

pKa = 2,2
pKb = 9,8
pK R = 4,3

pI asam amino

ASAM GLUTAMAT
= GLU
CO2 CH2 CH2 CH

CO2

NH3

pKa = 2,2
pKb = 9,8
pK R = 4,3

CO2

CO2H
CH2 NH3
CH2
CH2

OH

CO2

CH2 NH3
CH2

0 -1

OH

CH2

CO2 H

CO2 H
+1

-2

CO2

CH2 NH3
CH2

OH

CH2
CO2

CH2 NH2
-

CH2
CH2
CO2

Tugas 1
1. Jabarkan asam amino berdasarkan:
a. Gugus fungsi
b. Sifat esensian dan non esensial
c. Kepolaran
berikut dengan sumbernya
2. Tentukan pI asam amino berikut:
- CYSTEIN = cys dengan
pKa = 1.7 ; pKb = 10.8 ; pKR = 8.3
- METIONIN = met dengan
pKa = 2.3 ; pKb = 9.2

ASAM AMINO

PROTEIN

- ALANIN m/ Co Enzym A
(asetilasa)
d/ as, pantotenat vitamin
C C CO2
NH3+
TAURIN t.d/ sel, terikat pd as. Empedu
C C SO3diturunkan dari sistein

NH3+

TAURO CHOLAT

ASAM AMINO

PROTEIN

As. - AMINO BUTIRAT (GABA)

C C C CO2- m/ decarboksilasi A.

GLUTAMAT

NH3+

bakteri

d/ jar. Otak, ragi,

As. - AMINO ISO BUTIRAT m/ hasil

H3N+ C C CO2- katabolisme pirimidin d/

otot tnt
CH3

Penentuan a.a.
kromatografi daya partisi a.a
thadap fasa diam dan fasa gerak
mikrobiologi mikroorganisme
kolorimetri perband. warna p.
suatu Rx.
REAKSI WARNA

Rx warna asam amino

NAMA
NIN-HIDRIN

PEREAKSI
Nin-hidrin

NITRO
PRUSID

Na-nitroprusid/
NH4OH encer

SISTEIN

Merah

HOPKINSCOLE

As. glioksilat/
H2SO4

TRIPTOFAN

Ungu

MILLON

HgNO3 / HNO3

TIROSIN

Merah

KSANTO
PROTEIN

HONO2

Tir, trp, phe

(inti benzen)

Kuning

SAKAGUCHI

Alfa-naftol + Nahipoklorit

ARGININ

Merah

SULLIVAN

Na-naftokuinon1,2-sulfonat-4

SISTEIN

Merah

pekat

a.a.

WARNA
Ungu
Ruheman

Rx warna asam amino

NAMA

PEREAKSI

a.a.

WARNA

SULLIVAN

Na-naftokuinon1,2-sulfonat-4

SISTEIN

Merah

PAULY

Na-hipoklorit,
As.Sulfanilat yang
didiazokan d. basa

TIROSIN
HISTIDIN

Merah

EHRLICH

p-dime-aminobenzaldehid/ HCl
12N

TRIPTOFAN

Biru

FOLINCASCALTEU

As. fosfomolibdotungstat

TIROSIN

Merah

PEPTIDA
O

O
H2N

CH C

OH

H2N

CH C

OH

R2

R1

a.a 2

a.a. 1
O
H 2N

CH C

O
H
N

R1
Residu N

CH C

OH

R2
Ikatan
peptida

Residu C

TATA NAMA
INA IL
Dari ujung kiri kanan, atau ujung C
ujung C
Glutation = - glutamil sisteil glisin

Glu - cys - gly

Contoh:

cys - tyr - ile - gln - asn - cys

- pro - leu - gly-NH2
Oksitosin
KONTRAKSI UTERUS & LAKTASI,

MERANGSANG KELAHIRAN

Tugas 2
Tulis

asam amino yang bukan

pembentuk protein min 5 macam.
Tulis peptida yang lain, berikut
dengan fungsinya

PENENTUAN STRUKTUR
PEPTIDA
JENIS DAN BANYAK ASAM AMINO
(AMINO ACID ANALYZER).
URUTAN ASAM AMINO
ANALISIS RESIDU UJUNG N
1. PEREAKSI SANGER 2,4DINITROFLUOROBENZEN (DNP)
FLUORO BEREAKSI DENGAN GUGUS
NH2 PADA RANTAI

2. PEREAKSI EDMAN FENIL

ISOTIOSIANAT
PENANDAAN DAN PEMBEBASAN
AA UJUNG N HETEROSIKLIK
FENILTIOHIDANTOIN + A A
BERIKUT
PEMUTUS POLIPEPTIDA SPESIFIK
ENZIM PROTEOLITIK

ENZIM PROTEOLITIK
No.

PEREAKSI

1.

KIMOTRIPSIN

SISI
PEMUTUS
Phe, Tyr, Trp

2.

PEPSIN

Tyr, Phe, Trp

3.

TERMOLISIN

Ile, Leu, Val

4.

TRIPSIN

Lys, Arg

5.

SIANOGEN BROMIDA (CNBr)

Met

6.

KARBOKSI PEPTIDASE

ASAM AMINO
UJUNG C

PROTEIN POLIAMIDA
PEPTIDA
PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA
> 100 a.a.
< 100 a.a.
H2 O
a. a.a. Prot. Sederhana
a.a. + bukan a.a. Prot. Majemuk
hem, k.h., l, as. nukleat

SIFAT-SIFAT PROTEIN
1. LARUT DENATURASI
BER (-) KELARUTAN
HILANGNYA
KEAKTIFAN ENZIM,
HORMON
# DIHABLURKAN
KEMBALI
PERUB. STR.
PEMECAHAN IKATAN
KOAGULASI DENATURASI
PERMANEN

SIFAT-SIFAT PROTEIN
2. KOLOID HIDROFIL
( -NH2, -COOH, -OH )
3. AMFOTER
4. PROTEIN (-) mengikat KATION
PROTEIN (+) mengikat ANION
5. BERDIALISIS

6. Rx. PRESIPITASI:

As. Mineral <<< mengendap, >>>

larut
Basa H2O mengendap
Pereaksi alkaloid mengendap. Bila
pH = pI

(trikloro asetat, as. tanat, dll)

garam dr. logam berat, mengendap
tgt. PH, suhu, e-lit
alkohol, mengendap, >>> efektif pada
pI
pemanasan koagulasi # larut
suhu eff. 38 oC - 75 oC

KLASIFIKASI PROTEIN
TUGAS
a.

PROTEIN SERAT pembentuk otot, kulit,

(Fibrous protein) rambut, dinding pembuluH darah
tdd. Molekul yang panjang, erat
dan larut d. air
Contoh:
Kolagenjar. Penyambung kaya OH-prolin
Elastin urat & pembuluh darah
Keratin rambut, kuku, bulu burung kaya
sistein & sistin

KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS

b. PROTEIN GLOBULAR mlkk berbagai
fungsi (tipe fungsional)

larut d. air

Contoh:
Hb pembawa oksigen ke sel
Insulin berperan dalam metabolisme
karbohidrat
Antibodi membentuk protein asing
menjadi tidak aktif
Fibrinogen memb. serat2 tdk larut yg
menggump. darah
Hormon membawa pesan keseluruh tubuh

KLASIFIKASI PROTEIN
TUGAS
ENZIM KATALIS BIOLOGIK
HORMON PEMBAWA BERITA
KIMIA
PROT. TRANSPOR PEMBAWA
MOLEKUL KECIL
PROT. CADANGAN ,
Seperti :

Kasein susu
Ovalbumin putih telur

KLASIFIKASI PROTEIN
TUGAS
PROTEIN KONYUGASI bersenyawa dengan
(conyugate protein)
non protein
Contoh:
- as nukleat nukleo protein
- > 4% karbohidrat muko protein
- < 4% karbohidrat gliko protein
- lipid lipoprotein
pospolipid
kolesterol
- zat warna kromo protein
- asam pospat fosfo protein
- ion logam metalo protein

STRUKTUR PROTEIN

STRUKTUR PRIMER

m/ rentetan a.a. molekul protein, akibat ik.

PEPTIDA
PENENTU IDENTITAS PROTEIN

STRUKTUR SEKUNDER
Ik. HIDROGEN
Ik. DISULFIDA

MELILITNYA RANTAI POLIPEPTIDA

STRUKTUR TERSIER
Ik. HIDROGEN

GAYA VAN DER WALLS

PELIPATAN LAPISAN

STRUKTUR KUARTERNER SEP. BOLA-BOLA

Tugas 3
Jelaskan

bagaimana protein
terbentuk akibat struktur protein
yang ada (4)

ASAM NUKLEAT
ASAM NUKLEAT
(DNA , RNA)
polimer
NUKLEOTIDA
BASA NITROGEN NUKLEOSIDA
1 UNIT GULA
NUKLEOTIDA
1 GUGUS FOSFAT
ik. Kovalen
hetero atom pada P & P dari C 1
pada Gula

 Misal nukleosida:
ADENIN + D.2 DEOKSI RIBOSA
NH2
N

9
N

HO
5'
H
H

OH

O
1'

Misal Nukleotida pirimidin:

URIDIN TRIPOSPAT(UTP)
O
NH
O-

O-

HO P

O P

O
O

P
O-

5'

O
4'

O
1'

H
H

3'
OH

2'
OH

NUKLEOTIDA MONOPOSPAT
UTAMA
NUKLEOTIDA

NAMA BASA

UNSUR
NUKLEOSIDA

RIBO
NUKLEOTIDA
- AMP
- GMP
- CMP
-DEOKSI
UMP RIBO

ADENIN
GUANIN
SITOSIN
URASIL

ADENOSIN
GUANOSIN
SITIDIN
URIDIN

NUKLEOTIDA
- d AMP
- d GMP
- d CMP

ADENIN
GUANIN
SITOSIN

deoksi ADENOSIN
deoksi GUANOSIN
deoksi SITIDIN

Tugas 1
1. Jabarkan asam amino berdasarkan:
a. Gugus fungsi
b. Gugus R
c. Kepolaran
berikut dengan sumbernya
2. Tentukan pI asam amino berikut:
- CYSTEIN = cys dengan
pKa = 1.7 ; pKb = 10.8 ; pKR = 8.3
- METIONIN = met dengan
pKa = 2.3 ; pKb = 9.2

Tugas 2
Tulis

peptida yang lain berikut

dengan fungsinya

Tugas 3
Jelaskan

bagaimana protein
terbentuk akibat struktur protein
yang ada (4)

Tugas:
1. Jabarkan asam amino pembentuk
protein berdasarkan:
a. Gugus fungsi
b. Gugus R
c. Kepolaran
2.

Tulis peptida yang berkhasiat

terhadap manusia