ASAM AMINO,

PROTEIN
&
ASAM NUKLEAT

Kuliah Biomedik 1
Fakultas Kedokteran
Universitas Tarumanagara
MAKANAN NORMAL

campuran kompleks
bahan-bahan tumbuhan dan
binatang

PROTEIN, LEMAK,
KARBOHIDRAT
DEFINISI

PROTEIN PROTEIOS
Il
Pertama
POLIAMIDA

Asam-asam amino = 20
macam
STRUKTUR UMUM

H2N CH C OH

O O
+
H2N CH C H3N CH C
-
OH O
R R
ION
DIPOLAR
ZWITTER
ION
RANTAI SAMPING

R = alifatik gly, ala, val,

leu, ile, pro
R = hidrosiklik ser, thr
R = aromatik phe, tyr, trp
R = asam asp, glu
R = amida asn, gln
R = basa lys, arg, his
R = mengand. S cys, met
Contoh:
Alani O
ala H2N CH C
A
OH
CH3

Fenil NH2
O
Alanin H2
phe C CH C

F OH
KONFIGURASI

CHO COOH
..
HO C H H 2N C H

CH OH R
2
L-Gliseraldehid asam L-amino
 Titik isoelektrik

H -
OH H - O H- H -
R C COOH R C COO R C COO
+ H+
+ H +
NH3 NH3 NH2

Jadi pI = ( pK kiri + pK kanan)

 ALANIN = ALA
H - pKa = 2,3
CH3 C COO
NH3
+ pKb = 9,7

H - -
OH H - OH H -
CH3 C COOH CH3 C COO + CH3 C COO
+ H
+ H +
NH3 NH3 NH2
2,3 9,7
+1 0 -1

pI = ( 2,3 + 9,7) = 6
 pI = ( 2,2 + 4,3) = 3,25
Lysin = LYS
pKa = 2,2 ; pKb= 9,0; pKR=
10,5
 Asam glutamat

- -
CO2 CH2 CH2 CH CO2 pKa = 2,2
+
NH3 pKb = 9,8

pK R = 4,3

pI asam amino
ASAM GLUTAMAT
= GLU -
CO2 CH2 CH2 CH CO2
-
pKa = 2,2
+
NH3 pKb = 9,8

pK R = 4,3
- -
- CO2 CO2
CO2H CO2
+
+
CH2 NH3
+ CH2 NH3 CH2 NH2
CH2 NH3
CH2 CH2
CH2 CH2 - -
OH
- OH OH
CH2 CH2
CH2 + CH2 +
H
+
H H
- -
CO2 CO2
CO2 H CO2 H

+1 0 -1 -2
 Tugas 1

1. Jabarkan asam amino berdasarkan:

a. Gugus fungsi
b. Sifat esensian dan non esensial
c. Kepolaran
berikut dengan sumbernya
2. Tentukan pI asam amino berikut:
- CYSTEIN = cys dengan
pKa = 1.7 ; pKb = 10.8 ; pKR = 8.3

- METIONIN = met dengan

pKa = 2.3 ; pKb = 9.2
 ASAM AMINO PROTEIN
- ALANIN m/ Co Enzym A
(asetilasa)
d/ as, pantotenat vitamin
C C CO2-

NH3+
TAURIN t.d/ sel, terikat pd as. Empedu
C C SO3- diturunkan dari sistein

NH3+ TAURO CHOLAT
 ASAM AMINO PROTEIN
As. - AMINO BUTIRAT (GABA)
C C C CO2- m/ decarboksilasi A.
GLUTAMAT
NH3+ d/ jar. Otak, ragi,
bakteri

As. - AMINO ISO BUTIRAT m/ hasil

H3N+ C C CO2- katabolisme pirimidin d/
otot tnt
CH3
 Penentuan a.a.
kromatografi daya partisi a.a
thadap fasa diam dan fasa gerak
mikrobiologi mikroorganisme
kolorimetri perband. warna p.
suatu Rx.

REAKSI WARNA
 Rx warna asam amino
NAMA PEREAKSI a.a. WARNA
NIN-HIDRIN Nin-hidrin Ungu
Ruheman
NITRO Na-nitroprusid/ SISTEIN Merah
PRUSID NH4OH encer
HOPKINS- As. glioksilat/ TRIPTOFAN Ungu
COLE H2SO4
MILLON HgNO3 / HNO3 TIROSIN Merah
KSANTO HONO2 pekat
Tir, trp, phe Kuning
PROTEIN (inti benzen)
SAKAGUCHI Alfa-naftol + Na- ARGININ Merah
hipoklorit
SULLIVAN Na-naftokuinon- SISTEIN Merah
1,2-sulfonat-4
 Rx warna asam amino
NAMA PEREAKSI a.a. WARNA
SULLIVAN Na-naftokuinon- SISTEIN Merah
1,2-sulfonat-4

PAULY Na-hipoklorit, TIROSIN Merah

As.Sulfanilat yang HISTIDIN
didiazokan d. basa

EHRLICH p-dime-amino- TRIPTOFAN Biru

benzaldehid/ HCl
12N

FOLIN- As. fosfomolibdo- TIROSIN Merah

CASCALTEU tungstat
PEPTIDA
O O

H2N CH C OH + H2N CH C OH

R1 R2

a.a. 1 a.a 2

O O

H 2N CH C H CH C OH
N
R1 R2

Ikatan Residu C
Residu N
peptida
 TATA NAMA

INA IL
Dari ujung kiri kanan, atau ujung C
ujung C

Glutation = - glutamil sisteil glisin

Glu - cys - gly
Contoh:

S S

cys - tyr - ile - gln - asn - cys

- pro - leu - gly-NH2
Oksitosin

KONTRAKSI UTERUS & LAKTASI,

MERANGSANG KELAHIRAN
Tugas 2

Tulis asam amino yang bukan

pembentuk protein min 5 macam.
Tulis peptida yang lain, berikut
dengan fungsinya
 PENENTUAN STRUKTUR
PEPTIDA
JENIS DAN BANYAK ASAM AMINO
(AMINO ACID ANALYZER).
URUTAN ASAM AMINO
ANALISIS RESIDU UJUNG N
1. PEREAKSI SANGER 2,4-
DINITROFLUOROBENZEN (DNP)
FLUORO BEREAKSI DENGAN GUGUS
NH2 PADA RANTAI
 2. PEREAKSI EDMAN FENIL
ISOTIOSIANAT
PENANDAAN DAN PEMBEBASAN
AA UJUNG N HETEROSIKLIK
FENILTIOHIDANTOIN + A A
BERIKUT

PEMUTUS POLIPEPTIDA SPESIFIK

ENZIM PROTEOLITIK
 ENZIM PROTEOLITIK
No. PEREAKSI SISI
PEMUTUS
1. KIMOTRIPSIN Phe, Tyr, Trp
2. PEPSIN Tyr, Phe, Trp
3. TERMOLISIN Ile, Leu, Val
4. TRIPSIN Lys, Arg
5. SIANOGEN BROMIDA (CNBr) Met
6. KARBOKSI PEPTIDASE ASAM AMINO
UJUNG C
PROTEIN POLIAMIDA
PEPTIDA
PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA
> 100 a.a. < 100 a.a.
H2 O

a. a.a. Prot. Sederhana

a.a. + bukan a.a. Prot. Majemuk

hem, k.h., l, as. nukleat

 SIFAT-SIFAT PROTEIN
1. LARUT DENATURASI
BER (-) KELARUTAN
HILANGNYA
KEAKTIFAN ENZIM,
HORMON
# DIHABLURKAN
KEMBALI
PERUB. STR.
PEMECAHAN IKATAN
KOAGULASI DENATURASI
PERMANEN
SIFAT-SIFAT PROTEIN
2. KOLOID HIDROFIL
( -NH2, -COOH, -OH )

3. AMFOTER

4. PROTEIN (-) mengikat KATION

PROTEIN (+) mengikat ANION
5. BERDIALISIS
6. Rx. PRESIPITASI:
As. Mineral <<< mengendap, >>>
larut
Basa H2O mengendap
Pereaksi alkaloid mengendap. Bila
pH = pI
(trikloro asetat, as. tanat, dll)
garam dr. logam berat, mengendap
tgt. PH, suhu, e-lit
alkohol, mengendap, >>> efektif pada
pI
pemanasan koagulasi # larut
suhu eff. 38 oC - 75 oC
 KLASIFIKASI PROTEIN
TUGAS
a. PROTEIN SERAT pembentuk otot, kulit,
(Fibrous protein) rambut, dinding pembuluH darah
tdd. Molekul yang panjang, erat
dan larut d. air

Contoh:
Kolagenjar. Penyambung kaya OH-prolin
Elastin urat & pembuluh darah
Keratin rambut, kuku, bulu burung kaya
sistein & sistin
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
b. PROTEIN GLOBULAR mlkk berbagai
fungsi (tipe fungsional)
larut d. air
Contoh:
Hb pembawa oksigen ke sel
Insulin berperan dalam metabolisme
karbohidrat
Antibodi membentuk protein asing
menjadi tidak aktif
Fibrinogen memb. serat2 tdk larut yg
menggump. darah
Hormon membawa pesan keseluruh tubuh
 KLASIFIKASI PROTEIN
TUGAS
ENZIM KATALIS BIOLOGIK
HORMON PEMBAWA BERITA
KIMIA
PROT. TRANSPOR PEMBAWA
MOLEKUL KECIL
PROT. CADANGAN ,
Seperti : Kasein susu
Ovalbumin putih telur
 KLASIFIKASI PROTEIN
TUGAS
PROTEIN KONYUGASI bersenyawa dengan
(conyugate protein) non protein
Contoh:
- as nukleat nukleo protein
- > 4% karbohidrat muko protein
- < 4% karbohidrat gliko protein
- lipid lipoprotein
pospolipid
kolesterol
- zat warna kromo protein
- asam pospat fosfo protein
- ion logam metalo protein
 STRUKTUR PROTEIN
STRUKTUR PRIMER
m/ rentetan a.a. molekul protein, akibat ik.
PEPTIDA
PENENTU IDENTITAS PROTEIN

STRUKTUR SEKUNDER
Ik. HIDROGEN
Ik. DISULFIDA MELILITNYA RANTAI POLIPEPTIDA

STRUKTUR TERSIER
Ik. HIDROGEN
GAYA VAN DER WALLS PELIPATAN LAPISAN

STRUKTUR KUARTERNER SEP. BOLA-BOLA

Tugas 3

Jelaskan
bagaimana protein
terbentuk akibat struktur protein
yang ada (4)
 ASAM NUKLEAT
ASAM NUKLEAT
(DNA , RNA)
polimer

NUKLEOTIDA

BASA NITROGEN NUKLEOSIDA

1 UNIT GULA NUKLEOTIDA
1 GUGUS FOSFAT
ik. Kovalen

hetero atom pada P & P dari C 1

pada Gula
 Misal nukleosida:
ADENIN + D.2 DEOKSI RIBOSA
NH2

N
N

9
N N
HO
5'
O
H H 1'

H H
OH H
 Misal Nukleotida pirimidin:
URIDIN TRIPOSPAT(UTP)
O

NH

O- O- O N O

HO P O P O P O 5'
O
O O O-
4' H H 1'

H H
3' 2'
OH OH
 NUKLEOTIDA MONOPOSPAT
UTAMA
NUKLEOTIDA NAMA BASA UNSUR
NUKLEOSIDA
RIBO
NUKLEOTIDA
- AMP ADENIN ADENOSIN
- GMP GUANIN GUANOSIN
- CMP SITOSIN SITIDIN
UMP RIBO
-DEOKSI URASIL URIDIN
NUKLEOTIDA
- d AMP ADENIN deoksi ADENOSIN
- d GMP GUANIN deoksi GUANOSIN
- d CMP SITOSIN deoksi SITIDIN
 Tugas 1

1. Jabarkan asam amino berdasarkan:

a. Gugus fungsi
b. Gugus R
c. Kepolaran
berikut dengan sumbernya
2. Tentukan pI asam amino berikut:
- CYSTEIN = cys dengan
pKa = 1.7 ; pKb = 10.8 ; pKR = 8.3

- METIONIN = met dengan

pKa = 2.3 ; pKb = 9.2
Tugas 2

Tulis
peptida yang lain berikut
dengan fungsinya
Tugas 3

Jelaskan
bagaimana protein
terbentuk akibat struktur protein
yang ada (4)
Tugas:

1. Jabarkan asam amino pembentuk

protein berdasarkan:
a. Gugus fungsi
b. Gugus R
c. Kepolaran

2. Tulis peptida yang berkhasiat

terhadap manusia