E N ZY M

BLOK 8
LEARNING OBJECTIVE
Setelah mengikuti perkuliahan ini, mahasiswa
mampu memahami :
Nomenclature enzim
Siafat-sifat enzim
Kinetics enzim
Mekanisme Kerja enzim
 REFERENSI

Harpers Illustrated Biochemistry.

Murray, R.K; D.K. Granner; P.A; Mayes.
V.W. Rodwell. 2003. Twenty-Seventh
Edition. International Edition. Mcgraw-
Hill Companies inc. Lange Medical
Publication
3
 PENDAHULUAN
MAKANAN DICERNA DIMETABOLISME dalam
dalam saluran sel
pencernaan
METABOLISME :
KATABOLISME
MOLEKUL YG LEBIH BESAR MOLEKUL YG LEBIH KECIL
GLUKOSA CO2 + H2O + ENERGI
ANABOLISME = SINTESIS
MOLEKUL YG LEBIH KECIL MOLEKUL YG LEBIH BESAR
GLUKOSA GLIKOGEN

ENZIM
SEL JARINGAN ORGANISME
tersusun dari molekul2

4 REAKSI KIMIA
 LETAK ENZIM DALAM SEL
- ENZIM MITOKONDRIAL :
Reaksi pengadaan energi, reaksi oksidasi yang
menghasilkan energi
- ENZIM RIBOSOMAL :
Reaksi biosintesis protein
ENZIM INTI :
Berkaitan dengan perangkat genetika
ENZIM LISOSIM :
.Berkaitan dengan proses digestif intrasellular,
.Destruksi hidrolitik bahan yang tak diperlukan sel
Enzim mikrosomal :
. Reaksi hidroksilasi dalam sintesis hormon steroid
.Metabolisme dan inaktivasi obat

5
 LETAK ENZIM DALAM SEL
BERKAITAN DGN FUNGSI ORGANEL Ybs.
E. MITOKONDRIAL REAKSI PENGADAAN ENERGI
Reaksi oksidasi Energi
Rantai respirasi dalam mitokondria
E. RIBOSOMAL SINTESIS PROTEIN
KATALISATOR mempercepat reaksi
IKUT SERTA DALAM REAKSI KIMIA & MEMPERCEPAT REAKSI
KIMIA, TETAPI PD. AKHIR REAKSI AKAN DIDAPAT KEMBALI
SEPERTI SEMULA
DIBUTUHKAN DLM. JUMLAH KECIL

CELAH AKTIF

E
+ S
+
P
6 KOMPLEKS [ES] E
 Enzim merupakan senyawa
organik bermolekul besar
(komponen utama protein)
yang berfungsi untuk
mempercepat jalannya reaksi
metabolisme di dalam tubuh
tanpa mempengaruhi
keseimbangan reaksi
 Enzim tidak ikut bereaksi,
struktur enzim tidak berubah
baik sebelum dan sesudah
reaksi tetap
Enzim sebagai biokatalisator
Bagian enzim yang aktif
adalah sisi aktif dari enzim
 KATALISATOR ENZIM
INORGANIK
1. H+, OH-, Pt 1. PROTEIN
biokatalisator
2. E. aktivasi
2. E aktivasi
3. -
3. BEREAKSI SPESIFIK
4. - 4. TIDAK TAHAN PANAS

9
 kead. transisi

G tanpa katalisator

E. level
Ea
=

dgn katalisator inorg

E. bebas
Ea'
dgn enzim

Ea''
kead. awal G = Perubahan
E. bebas

kead. akhir

Perjalanan
10 reaksi
 KLASIFIKASI & TATANAMA ENZIM

TATANAMA ENZIM IUBMB:

NAMA ENZIM T.D. 2 BAGIAN:
Bgn. 1 NAMA SUBSTRAT
Bgn. 2 JENIS REAKSI + ASE

11
 Nomenklatur
Umumnya nama:
Contoh:
Phosphofructokinase
Acetylcholinesterase
DNA Polymerase
Secara Tradisional penamaan
enzim ditambahkan. ase Enzim pengendali glikolisis, memerlukan
Misal : energi tubuh agar berjalan
Proteinase (enzim) substrat
Protein
Acetylcholinesterase bekerja memecah Acetylcholine menjadi Acetate dan
Choline, enzim ini dapat dihambat insektisida maka Acetylcolie tdk pecah
akibatnya menumpuk dan menyebabkan kontrakasi otot sampai kejang
pada nyamuk mati
 KELAS-KELAS ENZIM
ADA 6 KELAS (GOLONGAN) UTAMA :
1. OKSIDOREDUKTASE :
MENGKATALISIS REAKSI OKSIDASI REDUKSI.
P.U. : ENZIM2 PD. PROSES OKSIDASI BIOLOGIS

PIRUVAT + NADH + H+ Laktat dehidrogenase LAKTAT + NAD+

2. TRANSFERASE :
MENGKATALISIS REAKSI2 PEMINDAHAN GUGUS FUNGSIONAL (BUKAN
HIDROGEN) MISAL AMINA, KARBOKSIL, METIL, ASIL DLL.
SG + S SG + S
Mg++
-D-GLUKOSA+ATP Heksokinase -DGLUKOSA-6-P +ADP
Glukokinase
3. HIDROLASE :
MENGKATALISIS PEMUTUSAN IKATAN KOVALEN SAMBIL MENGIKAT AIR
Contoh : Enzim - Amilase
- Lipase
- Karboksi peptidase A

14
 KELAS-KELAS ENZIM
Reaksi -D-GALAKTOSIDA + H2O = suatu alkohol + D-galaktosa
4. LIASE (LYASE) :
MENGKATALISIS REAKSI PEMBENTUKAN ATAU PEMECAHAN IKATAN RANGKAP DUA, ATAU
PEMBELAHAN LAIN YG. MENYANGKUT PENYUSUNAN KEMBALI ELEKTRON (MEMUTUS
IKATAN KOVALEN TANPA MENGIKAT AIR)
Contoh :
ALDOLASE : KETOSA-I-P ALDOSA + DIHIDROKSI ASETON-P
FUMARASE :
HO CH COOH H C COOH
| = || + H2 O
CH2 COOH HOOC C H
MALAT FUMARAT
PIRUVAT DEKARBOKSILASE :
O O
|| ||
OOC C CH + H+ CO2 + H C CH3
3
PIRUVAT ASETALDEHID

15
 KELAS-KELAS ENZIM
5. ISOMERASE :
MENGKATALISIS REAKSI ISOMERISASI.
All Trans retinin 11 cis retinin

6. LIGASE :
MENGGABUNGKAN 2 MOLEKUL, DISERTAI PEMUTUSAN IKATAN
PIROFOSFAT PD. ATP ATAU SENYAWA SEJENIS (MENGKATALISIS
PEMBENTUKAN IKATAN KOVALEN)
Mis :
~ PIRUVAT KARBOKSILASE :
O O
|| ||
OOC C CH + CO ATP ADP+Pi
3 2 OOC C CH2 COO
PIRUVAT OKSALOASETAT

16
 Klasifikasi Enzim
Dehidrogenase- Oksidasi substrat
menggunakan Kofaktors sebagai akseptor
atau donor elektron.
contoh: Piruvate dehidrogenase)
Reductase- : menambah elektrons dari
kofaktor reduksi
Contoh: enoyl ACP reduktase
Kinase- : phosphorilase substrate.
Contoh: hexokinase
Hidrolase : menggunakan air untuk
memecah Molekul.
Phosphatase : - hidrolisa ester phosphate.
Contoh: glucose-6-phosphatase.
Esterase (lipase): hidrolisa esters , sedangkan
yg bekerja pada ester lipid adalah lipase.
Contoh : lipoprotein lipase
Thioesterase : hidrolisa thioesters
Thiolase : - menggunakan thiol untuk
membantu pembentukan thioester.
Contoh: -ketothiolase.
Isomerase :- interkonversi dari isomer.
contoh: aldose ke ketose; triose phosphate
isomerase
 AKTIVITAS ENZIM

ENZIM PROTEIN TERSUSUN DARI ASAM AMINO

ASAM AMINO DALAM LARUTAN SELALU berbentuk ion tergantung pH larutan

R - C - COOH RUMUS UMUM ASAM AMINO

I
NH2

AKTIVITAS KATALITIK ENZIM ERAT HUBUNGANNYA DENGAN

STRUKTUR ENZIM (PROTEIN)
Contoh-contoh aktifitas enzim yang
umum

Kinase
Serine/Threonine (rantai
samping protein tdk aktif)
Tyrosine
Phosphatase (Pi posfat di
lepas)
Serin pada sisi aktif H
diganti PO4 memerlukan
1 ATP
 Susunan enzim
Komponen utama enzim adalah protein
Protein yang sifatnya fungsional
(bergerak dalam cairan sel), bukan
protein struktural(ada dalam jaringan
terikat)
Tidak semua protein bertindak sebagai
enzim contoh Albumin,Globulin.
 Protein Enzim protein
sederhana

Enzim
Enzim
Konjugasi

Protein +
Bukan Protein

Bukan protein =
Protein = apoenzim Gugus prostetik

Organik = Anorganik = kofaktor

Koenzim
Apoenzim adalah protein yang belum sebagai enzim berfungsi
bila ada koenzim (vitamin) atau kofaktor (logam) Mg, Zn, Co
dsb.
Heksokinase pada metabolisme Karbohidrat harus ada kofaktor
Mg.
 Enzim

Katalisator Biologis
Specifik untuk Reaksi Kimia; Tidak habis dipakai dalam reaksi, jadi
setelah reaksi enzim kembali lagi kebentuknya.
Apoenzime: protein
Kofaktor: Komponen Nonprotein
Coenzyme: Kofaktor Organik
Holoenzime: Apoenzime + kofaktor
Lock and Key Teori Fisher
Apoenzim tdk cocok dgn substrat dgn adanya koenzim jadi cocok (aktif)

Figure 5.3
Active side of enzyme
1. Fisher Theory : Lock and Key
Tanpa koenzim mis Acetylcholine,

E-Ko pakai ko enzim. S2 kofaktor/koenzim msk dari sisi yg jauh

dari sisi aktif dan akhirnya sisi aktifnya sesuai substratnya sehingga
reaksi berjalan.
2. Induced fit Khosland
Ada muatan perubahan konformasi. Lysin dan metionin pada sisi aktif ketarik.
Enzim allosteric (enzimk pengendali jalur reaksi)dipengaruhi dari jauh. Terjadi tarik menarik ion yg
berlawanan.
 Gugus hidrofobik dan gugus bermuatan (warna biru) sama-sama
terlibat dalam pengikatan substrat ( gugus pengikatan )
Gugus fosfoserin (-P) dan residu sistein (-SH) terlibat dalam
proses katalisis( gugus katalitik )
Lys dan Met tidak terlibat proses
Keadaan tanpa (S) gugus gugus katalitik dan gugus pengikatan
substrat terpisah dengan jarak beberapa ikatan
Mendekatnya substrat (S) menimbulkan perubahan konformasi
protein enzim yang menyusun gugus pengikatan substrat dan
katalitik
Pada saat yang sama daerah lain juga berubah, residu Lys dan
metionin mendekat
 Kecepatan reaksi enzim
The turnover number is generally 1-10,000 molecules per second.

Figure 5.4
Contoh koenzim
 Konezim Pelopor Vitamin Fungsi

Nikotinamide Adenine Di Nukletida (NAD+) Niasin Redoks

Nikotinamide Adenine Nukleotida Phosphat Niasin Redoks
(NADP+) Redoks
Flavin Adenine Dinukleotida (FAD) Riboflavin Redoks
Flavin Mononukleotida (FMN) Riboflavin Redoks
Asam Lipoat Tidak ada Redoks
Heme Tidak ada Oksidasi
Tiamin PiroPhosphat (TPP) Thiamin dekarboksilasi
Piridoksal Phosphat (Py) Piridoksin Transaminasi-
Rasemasi
Koenzim A ( Co ASH) Asam Pantotenat Transfer ggs asil.
Asam Tetrahidrofolat (THF) Asam Folat
Biotin Transfer Ggs
5'-Deoksiadenosil kobalamine ( Koenzim B 12) Kobalamin ( B 12) satu karbon.
Transfer CO2
Transfer ggs
metil
Oksidasi-reduksi
Keadaan tereduksi ATP akan teroksidasi ADP
teroksidasi lanjut AMP
Posfat terlepas satu -- > tereduksi
Enzim
Enzim dibentuk dalam protoplasma sel
Enzim beraktifitas di dalam sel tempat sintesisnya
(disebut endoenzim) maupun di tempat yang lain diluar
tempat sintesisnya (disebut eksoenzim)
Sebagian besar enzim bersifat endoenzim
Umumnya ada dalam sel, kalau ada di luar sel
menunjukkan ada sel yg rusak. Banyak yg rusak
patologis (enzim dalam darah meningkat) SGOT, SGPT
meningkat
 Enzim pada Diagnosa Patologis
1.Khas Enzim pada Hati yaitu AST (SGOT= Serum Glutamat Oxaloasetat
Amino transferase), & ALT (SGPT =Serum Glutamat-piruvate
Transminase) SGPT banyak dijumpai di hepatosit.. ;
Normal rasio SGPT/SGOT kurang dari 1

2..LDH ( Lactate Dehydrogenase) bila ada kenaikan dalam 12-24 jam

yaitu pada Kelainan Infark Jantung . Lalu kembali normal pada
hari ke 5-10.

3..CPK ( Creatine Phosphokinase atau CK) terutama dijumpai pada

Otot Jantung, otot Rangka dan juga otak Jadi Pemeriksaan ini
baik untuk mengetahui bila ada kelaianan, Pada organ Otot
Jantung, otot rangka dan otak. CPK-MB levelnya meningkat pada 3-6
jam serangan Infark jantung dan mencapai puncak 12-24 jam, normal
kembali bila tidak ada kerusakan lebih lanjut 12-48 jam.
 PENGUKURAN KADAR ENZIM DLM. PLASMA

UNTUK MEMBANTU DIAGNOSIS

ENZIM PLASMA FUNGSIONAL ENZIM PLASMA NON FUNGSIONAL

(YG. BERFUNGSI DLM. PLASMA) (YG. BERFUNGSI DI JARINGAN LAIN,
TIDAK DLM. PLASMA)

MIS. :
N : PERGANTIAN SEL (SEL MATI
ENZ.2 PROSES PEMBEKUAN DARAH
DIGANTI SEL BARU)
LIPOPROTEIN LIPASE
DIFFUSI PASIF

KADAR :
: SEL MATI
GANGGUAN PROSES SINTESIS DI HATI RADANG
/ (-) : KELAINAN GENETIK Ca
DEFISIENSI F VIII : HEMOFILIA TRAUMA
PENYAKIT GENETIK
(CONTOH: DMD)

GEN : SUATU SEGMEN DNA YG. BERISI INFORMASI/KODE GENETIK SUSUNAN

ASAM AMINO, SUATU RANTAI POLI-PEPTIDA/PROTEIN mRNA
POLPEPTIDA/PROTEIN
Sifat Enzim
1. Enzim bersifat koloid, luas permukaan besar, bersifat hidrofil
2. Dapat bereaksi dengan senyawa asam maupun basa, kation
maupun anion
3. Enzim sangat peka terhadap faktor-faktor yang menyebabkan
denaturasi protein misalnya suhu, pH dll
4. Enzim dapat dipacu maupun dihambat aktifitasnya
5. Enzim merupakan biokatalisator yang dalam jumlah sedikit
memacu laju reaksi tanpa merubah keseimbangan reaksi
6. Enzim tidak ikut terlibat dalam reaksi, struktur enzim tetap baik
sebelum maupun setelah reaksi berlangsung
7. Enzim bermolekul besar
8. Enzim bersifat khas/spesifik
 Dipacu dinaikkan kons substrat atau temp dinaikkan
Dihambat diberi inhibitor
Khas/spesifik hanya satu reaksi yg spesifik
kalau redoks akan bekerja di redoks saja.
 Spesifik: hanya cocok untuk satu macam substrat saja atau
sekelompok kecil substrat yang susunanya hampir sama dan
fungsinya sama

E5

A E1 B E2 C E3 D

E4
 Enzim
Suhu: optimum 30 C, minimum 0 C, maksimum 40 C
Logam, memacu aktifitas enzim: Mg, Mn, Co, Fe
Logam berat, menghambat aktivitas enzim: Pb, Cu,Cd, Ag, Hg
(inhibitor)
pH, tergantung pada jenis enzimnya (pepsin aktif kondisi asam,
amilase kondisi netral, tripsin kondisi basa)
Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim
Temperatur

Figure 5.5a
Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim
pH

Figure 5.5b
 Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim
Substrate concentration

Figure 5.5c
Enzim
Konsentrasi substrat, substrat yang banyak mula-mula memacu
aktifitas enzim, tetapi kemudian menghambat karena:
penumpukan produk (feed back effect)
Konsentrasi enzim, peningkatan konsentrasi enzim memacu
aktifitasnya
Air, memacu aktifitas enzim
Vitamin, memacu aktifitas enzim
Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim
Enzimes dapat berubah atau rusak oleh tempratur dan pH.
Tetramer terurai

Figure 5.6
 pH and Temperature Dependence

Enzim masing2 mempunyai pH dan temperature optimums

Pikirkan dimana enzim bekerja?
Contoh: Pepsin adalah aktif di lambung.
bekerja aktif pada suasana pH asam dan 37C

Apa yang terjadi pada protein umumnya pada pH/temperature yang

ekstrim?
Secara kinetik enzim bekerja menurunkan
rintangan energi ( E )
Enzim

Figure 5.2
Kinetik Michaelis Menten (( Kurva Enzim Saturasi)
Plot Dari Konsentrasi Substrat versus Reaksi Velocity
 Michaelis and Menten, and later Briggs and Haldane used
the scheme to drive a matematical expression :
Vmax (S)
V = --------------
Km + (S)
V : Kecepatan
Vmax : Kecepatan max
(S) : substrate concentration
Km : Michaelis constant
Km = 1(s) V = V max (s)/(s) (s) = V max.
Km 6 s V = 1/6 V max ( substrat boros, enzim boros dan
kecepata rendah.
 BILA [S] Km , MAKA V BERBANDING LURUS
DENGAN (S)
BILA [S] = Km , SEHINGGA V = 1/2 VMAX
BILA [S] Km , MAKA V = VMAX
 HARGA Km
MENUNJUKKAN AFFINITAS (DAYA IKAT) ENZIM
TERHADAP SUBSTRAT
APABILA SUATU ENZIM BEKERJA TERHADAP
LEBIH DARI 1 MACAM SUBSTRAT HARGA Km
UNTUK MASING-MASING SUBSTRAT BERBEDA,
CONTOH : ENZIM HEKSOKINASE

51
 ENZIM HEKSOKINASE :
SUBSTRAT Km (mM)
Glukosa 0,15
Fruktosa 1,15
ARTINYA HEKSOKINASE MEMPUNYAI AFFINITAS
TERHADAP GLUKOSA LEBIH BESAR DARIPADA
TERHADAP FRUKTOSA

52
Inversion of the Michaelis Menten Eq as
rereciprocals on Lineweaver-Burk plot
Fungsi Linier

1 = Km 1 + 1
V Vmax (S) Vmax
Figure LINEWEAVER-BURK PLOT
Menggambarkan kalau ada inhibitor
1
Vo

Km
Slope=
Vmax

1
Vmax

1
(S)
1
-
Km
Lineaer eq.
Enzim Inhibitor dibagi 2 kelompok:
1.Yang menyebabkan tidak aktifnya enzim Irreversible (
tidak bisa kembali lagi)
Effek inhibitor dapat kembali lagi. Inhibitor biasanya
menyebabkan tidak aktifnya modifikasi kovalen dari
struktur enzim.
Contohnya: Cyanida sebagai Klasik Enzim ireversible
inhibitor, dimana terikat secara
Kovalen pada Cytochrome Oxidase mitokondria. Dimana
akan menghambat semua Reaksi yang berhubungan
dengan transport elektron.
2.Reversible Inhibitor
a.Noncompetitive Inhibitor
b.Competive Inhibitor
c.Uncompetitive Inhibitor
Plot Lineweaver- Burks Enzim Inhibited (dihambat )
 Penghambatan aktifitas fungsional
enzim reversibel ada tiga tipe

1. Kompetitif: zat penghambat memp struktur yg mirip dengan substrat

sehingga dapat bergabung dgn sisi aktif enzim. Terjadi kompetisi
antara substrat dengan
inhibitor untuk bergabung dgn sisi aktif enzim (misal feed back effect)
2. Non kompetitif: zat penghambat menyebabkan struktur enzim rusak
sehingga sisi aktifnya tidak cocok lagi dgn substrat
3. Unkompetitif : enzim dan inhibitor masing2 bekerja sendiri2 tetapi
dpt mengubah bbrp parameter enzim
1. Competitive inhibition (etanol dan metanol berkompetesi thdp enzim yg
sama)

Slope, Km and Vmax ??? ( Parameter2

enzim)
( slope dan Km berubah, yg tdk berubah V max)

1
Vo

Km
Slope=
Vmax

Slope increases
1
Vmax

1
(S)
1
-
Km
 Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim
Competitive inhibition

Figure 5.7a, b
2. Noncompetitive Inhibition (Aspirin inhibitor pada enzym Cyclooksigenase (cox 1)
Km, Vmax and Slope decrease or increase ???(Slope dan V
max
berubah. Km tdk berubah.) new line after inhibition
1
Vo Slope increases

Km
Slope=
Vmax

1
Vmax

1
(S)
1
-
Km
Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim
Noncompetitive inhibition

Figure 5.7a, c
3.Uncompetitive inhibition
Slope, Km and Vmax ?? Change/ no change (slope tdk berubah
karena sejajar, yg berubah Km dan V max)

1 new line after inhibition

Vo Slope no change

Km
Slope=
Vmax

1
Vmax

1
(S)
1
-
Km
Faktor mempengaruhi aktifitas Enzim

Feedback
inhibition
Satu jalur reaksi
substrat dan enzim ( 4)
ada produk akhir.
Produk akhir
menghambat enzim
diatasnya secara non
kompetitif sehingga sisi
aktifnya berubah
bentuk sehinga jalur
tdk berjalan.

Figure 5.8
The future.