Klasifikasi Virus

Reina Puspita R., drh., M.Si.

Laboratorium Mikrobiologi
Fakultas Kedokteran Hewan UWKS
 GENOM VIRUS

► DNA atau RNA

► Single strandes (ss) atau double stranded
(ds)
 KLASIFIKASI VIRUS BERDASARKAN
1. JENIS ASAM NUKLEAT

DNA atau RNA

Dibedakan dengan pemberian :

► 5-iodo-2 deoksiuridin (IUDR)
► 5-fluoro-2 deoksiuridin (FUDR)
► 5-bromo-2 deoksiuridin (BUDR)
► Virus DNA dihambat, Virus RNA tidak dihambat
JENIS UNTAIAN

→ Dengan Mikroskop Fluorescence

→ Virus ss + acridin orange → merah

→ Virus ds + acridin orange → kuning
kehijauan
Virus DNA
► Genom berupa molekul tunggal
► semua ds, kecuali Parvoviridae & Circoviridae
► Bentuk linier atau sirkuler
► Polaritas / sense plus (+) atau minus (-)

Virus RNA
► Genom berupa molekul tunggal (monopartit) atau
bersegmen (multipartit)
birnavirus (2 segmen) & reovirus (10-12 segmen)
► Semua ss, kecuali Reoviridae & Birnaviridae
► Polaritas / sense plus (+) atau minus (-)
► Polaritas hanya berlaku untuk genom
untai tunggal (ss)
► Polaritas plus : memiliki urutan
nukleotida yang sama dengan urutan
nukleotida mRNA, contoh: Picornavirus,
calicivirus, togavirus, flavivirus,
coronavirus, torovirus, retrovirus
► Polaritas minus : memiliki urutan
nukleotida yg berkomplemen dengan
urutan nukleotida mRNA, contoh:
Paramyxovirus, rhabdovirus, filovirus,
orthomyxovirus,
 TATANAMA
► Urutan tatanama :
Ordo, famili, subfamili, genus, spesies

▪ Ordo : akhiran –virales

▪ Famili : -viridae
▪ Subfamili : -virinae
▪ Genus : -virus
▪ Spesies
▪ Dibawah spesies : subspesies, strain & varian
(hanya untuk tujuan praktis : pengembangan
vaksin & diagnostik)
Keluarga virus DNA
► Parvoviridae (Genus: Parvovirus,
Dependovirus/ adeno associated virus)
► Hepadnaviridae (Genus:
Orthohepadnavirus, Avihepadnavirus)
► Papovaviridae (Papillomavirus,
Pollyomavirus)
► Adenoviridae (Mastadenovirus-
menyebabkan hepatitis contagiosa canis,
Aviadenovirus)- menyebabkan ILT dan EDS
► Herpesviridae * (Herpesvirus)
- alphaherpesvirinae (Herpes simplex like
virus)
Pada sapi: IBR, MCV
siklus replikasi pendek

- Bethaherpesvirinae (cytomegalovirus)
-Gammaherpesvirinae (lymphoproliferative
virus)
pada ayam: marek disease
► Poxviridae*
▪ Genus : Orthopoxvirus (v. vaccinia)
▪ Genus : Capripoxvirus (v. sheeppox)
▪ Genus : Leporipoxvirus (v. myxoma)
▪ Genus : Suipoxvirus (v. swinepox )
▪ Genus : Molluscipoxvirus (v. moluscum
contagiosum)
▪ Genus : Yatapoxvirus (v. yabapox & tanapox)
▪ Genus : Avipoxvirus (v fowlpox)
▪ Genus : Parapoxvirus (v. Orf)

* Punya Amplop
Famili Envelope Symetri Kapsomer Transkriptase
Parvoviridae - Ikosahedral 132 SS (-) linier
Hepadnaviridae - Ikosahedral ? DS +circuler
Papovaviridae - Ikosahedral 72 DS + circular
Adenoviridae - Ikosahedral 252 DS + linear
Herpesviridae + Ikosahedral 162 DS – linear
Poxviridae + Kompleks - DS +linear
Iridoviridae + Ikosahedral 1892 DS +linear
VIRUS RNA
► Picornaviridae*
▪ Genus : Enterovirus
▪ Genus: Cardiovirus
▪ Genus: Aphtovirus (PMK)
► Caliciviridae* (Genus: Calicivirus)
► Togaviridae – menyebabkan BVD
► Flaviviridae (Flavivirus menyebabkan yellow
fever virus, Pestvirus menyebabkab hog
cholera)
► Coronaviridae (Coronavirus) menyebabkan
TGE, FIP, IB
► Rhabdoviridae (Virus serupa rabies)
► Filoviridae (Filovirus – Ebola)
► Orthomyxoviridae (Influenza A, B dan C)
► Reoviridae- menyebabkan bluetongue,
genus rotavirus menyebabkan keradangan
pada saluran cerna mamalia
► Birnaviridae- menyebabkan Gumboro
disease
► Paramyxoviridae (Paramyxovirus- ND dan
parainfluenza)
Famili Envelope Simetri Transkriptase
Picornaviridae - Ikosahedral SS +
Caliciviridae - Ikosahedral SS +

Togaviridae + Ikosahedral SS +

Flaviviridae + Ikosahedral SS +

Coronaviridae + Helix SS +
Paramyxoviridae + Helix SS -
Rhabdoviridae + Helix SS -
Filoviridae + Helix SS -
Orthomyxoviridae + Helix SS +
Birnaviridae - Ikosahedral Ds
 2. UKURAN DAN MORFOLOGI VIRUS

1. Tipe simetri
► Kubus / Ikosahedral
► Helix)

2. Ada / tanpa amplop

3. Jumlah kapsomer pd icosahedral

 3. KEPEKAAN THD ZAT KIMIA &
KEADAAN FISIK

► Peka thd eter, khloroform, sodium deoxycholate,

phospholipase, detergen: Natrium deoksikholat
► Suhu → protein permukaan dpt di denaturasi dlm
bbrp menit pd suhu 55-60º C

► pH dan lingkungan ionik → kebanyakan virus

beramplop inaktif pd pH 5-6, ttp rotavirus & beberapa
picornavirus tetap hidup pd pH asam
 4. Penyebaran virus dalam tubuh
► Virus Enterik (Rotavirus, Coronavirus,
Enterovirus, bbrapa Adenovirus)
► Virus Pernafasan (Orthomyxovirus,
Rhinovirus, Paramyxovirus, Coronavirus,
beberapa adenovirus
► Arbovirus (Semua Arbovirus, beberapa
flavivirus, Rhabdovirus dan Togavirus)
Maturnuwun