Professional Documents
Culture Documents
Production of Protein
Production of Protein
Protein
from Cloned Genes
A Studious Project
By , Mohaddese Pirzadeh,
Qazal Shidmand
Professor,dr Mohammad Javad Mokhtari
CHAPTER CONTENTS
• 13.1 Special vectors for the expression of foreign genes in E. coli
• 13.2 General problems with the production of recombinant
protein in E. coli
• 13.3 Production of recombinant protein by eukaryotic cells
biotechnology
• بیوتکنولوژی :استفاده از فرایند های بیولوژیکی در
صنعت و تکنولوژی بیوتکنولوژی تحت عنوان کاربرد سلول
زنده و سیستم ها با فرایند های زیستی در صنایع تولیدی
و خدماتی تعریف کرد
• در واقع بیوتکنولوژی بر یکپارچگی میکروب شناسی زیست
شناسی و شیمی و کامپیوتر تاکید دارد
• تکنولوژی صنعتی با تخمیر های الکلی شروع شده نظیر
تولید شراب و ابجو از سلولهای مخمر زنده در بریتانیا
که قدمت بیوتکنولوژی را به 4000سال رسانده است
• تولید ترکیبات دارویی ,غذایی ,صنعت ,هوا فضا ,استخراج
نفت و کشاورزی و تصفیه فاضالب ,بواسطه پیشرفت
بیوتکنولوژی نیز پیشرفت کردند
• الکساندر فلمینگ اولین کسی بود ک بطور جدی در زمینه
تولید آنتی بادی فعالیت کرد ومنجر به استفاده از قارچ
و باکتری جهت تولید آنتی بادی در مقیاس گسترده شد
• در سال 1939فلمینگ متوجه شد که در محیط کشت
استافیلوکوک:
• رشد قارچی بنام نوتاتوم و ترشح مایع آن در مجاور محیط
کشت باعث جلوگیری از رشد میکرو ارگانیسم میشود وی این
ماده ضد میکروبی ناشی از قارچ پنی سیلیوم نوتاتوم را
پنی سیلین نامید
• برای خالص سازی این انتی بیوتیک ها از دو روش استفاده
میشود
• کشت بسته bath culture
Bath culture
• کشت بسته میکرو ارگانیسم ها در ظزف های بزرگ حوای محیط
کشت رشدمیدهند که آنتی بادی حاصل از رشد آن ها را پس
از جداسازی سلولها حالص میکنند
• در تولید صنعتی پنی سیلین به روش کشته بسته دو فاکتور
مهم است
در محیط کشت • .1مقدار اولیه قارچ پنی سیلیوم موجود
مایع در دستگاه تخمیر کننده
• .2تراکم اکسیژن و غلظت قند ها در محیط کشت که در دمای
24درجه سانتی گراد کنترل میشود
• پس از گذشت مدت زمان الزم محصول تولید شده را از مخلوط
موجود در دستگاه تخمیر جدا میکنند
culture types
• روش قدیمی ) :)bathاستخراج محصول همراه با شستشوی
دستگاه که روش کشت بسته است
• روش جدید( : )continiuosاستفاده از یک لوله تخلیه کننده
برای تخلیه محصول است که به موعد تولید محصول پس ازمدت
زمان الزم محصول توسط لوله تخلیه کننده به بیرون هدایت
میشود و محصول مرتبا استخراج میگردد که به طور شبانه
روزی ادامه دارد و به آن روش کشت ممتد یا پیوسته گفته
میشود که بوسیله دستگاه فرمانتورانجام میگیرد و بصورت
پیوسته نیز امکان برداشت محصول از محیط کشت فراهم است
فرمانتوردستگاهی است که شرایط بهینه را
برای رشد میکرو ارگانیسمها مثل قارچ و
باکتری و مخمر فراهم میکند .میکرو
ارگانیسمها در این شرایط خاص ،بهتر و
بیشتر رشد وفعالیت خواهند کرد .استفاده
از فرمانتور به میکرو ارگانیسمها این
امکان را میدهد که پیش از انتقال به
مرحلهی تولید بیش از ده نسل رشد کنند
فرمانتور
Gene cloning
• یکی از دالیل پیشرفت بیوتکنولوژی کلونینگ ژن است
• تعداد زیادی از مواد تولیدی توسط میکروارگانیسم های بیوتکنولوژی توسط فرایند
کلونینگ ژن ها بروز و تخصصی شده اند که در شرایط طبیعی به این شکل میسر نبود
• ژن کلونینگ توسط انزیم های محدود کننده و برش دهنده که ژن پروتئین خاصی را
برش میدهند انجام میشود که پس از برش و الحاق به وکتور در مرحله
ترانسفورماسیون به داخل باکتری وارد میشود سپس اگر این مراحل صحیح انجام
شود پروتئین نوترکیب توسط ژن مورد نظر بیان میشود
.1کنترل مراحل ابتدایی بیان ژن یعنی اتصال RNAپلیمراز را به DNAبرعهده دارد •
مزایا: •
باعث کنترل ژنهای که فراورده حاصل از آنها مورد نیاز سلول است میشود •
• پروموتر وکتور بیانی باید از این نوع باشد که که باعث رونویسی ژن کلون شده در باالترین سرعت ممکن یشود
-2پروموتر ضعیف نسبتا ناکارآمد است و در ژن هایی که فرارده حاصل از آنها به مقدار کم مورد نیاز سلول •
است یافت میشود
امکان تنظیم پروموتر وجود دارد یا خیر ؟
دو نوع اصلی تنظیم ژن در E.Coliامکان پذیر است
-1القایی
-2کاهشی
نکات تنظیم ژن
• در روش تنظیم ژن القایی ژن با اضافه کردن مواد شیمیایی خاصی (یکی از
سوبستراهای آنزیم کد شده توسط ژن القایی ) ,به محیط کشت روشن
میشود.
• در روش تنظیم ژن کاهشی یا مهار شدنی ,ژن که با اضافه نمودن مواد خاصی
(تنظیمی) خاموش میشود .
• ماده شیمیایی که ژن تحت کنترل آن پروموتر را القا یا مهار میکند ,میتواند بیان
پروتئین نوترکیب را نیزتنظیم کند که یک مزیت عالی در تولید پروتئین نوترکیب
است.
انواع پروموتر
lacZپروموتر
• کنترل رونویسی ژن توسط کدکننده آنزیم بتا گاالگتوزیداز
• کنترل رونویسی ژن در وسط وکتور های M13mpو PUC
• ماده شیمیایی القا کننده آن ایزوپروپیل تیوگاالکتوزیداز
است
trpپروموتر
• باالدست مجموعه ای از ژنها که کد کننده انزیم های
درگیر در بیوسنتز امینو اسید تریپتوفان است
• ماده شیمیایی کاهشی تریپتوفان
• ماده شیمیایی القایی b-3- :انیدول اکریلیک اسید
tacپروموتر
• هیبرید بین پروموتر های لک و تریپتوفان
• قویتر از هر دوی آن هاست
• ماده القاکننده ایزوپروپیل تیو گاالکتوزیداز است
پروموتر المبدا پی ال
• پروموتور المبدا مسئول رونویسی فاژ المبدا است
• یک پروموتر خیلی قوی و توسط RNAپلیمراز مربوط به
E.COLIشناسایی و از در دمای باال DNAباکتریوفاژ
رونویسی میکند
• وکتور های بیانی حامل المبدا در نوعی E.COLIجهش یافته
باعث سنتز یک پروتئین حساس به حرارت میشود
• با فعالیت این پروتئین:
مخصوص RNAباکتریوفاژ تی 7که فاقد پوشش پروتئینی است ودو رشته ای است
,بسیار فعال تر از RNAپلیمراز E.COLIکه ژن وارد شونده به پایین دست پروموتر تی 7را در سطح باال بیان میکند
در این سویه در باال دست پروموتر لک قرار دارد که IPIGرا اضافه میکند و سپس RNA POL T7ساخته میشود و در
نتیجه باعث فعال سازی رونویسی ژن حمل شده توسط وکتور میشود
چرخه
لیزوژنی
پروموترها
کاست ها و اتصاالت ژنی
کارایی سیستم ترجمه مسنجر RNAبدست آمده از ژن کلون شده نه تنها به
حضور RBSبستگی دارد بلکه عالوه بر ان تحت تاثیر چند نوکلئوتید در شروع
ناحیه رمزگذاری میباشد
این مسئله حتما به این دلیل است که ساختار ثانویه حاصل از جفت بازهای
درون رشته ای میتواند با اتصال ربیوزوم به جایگاه اتصال آن تداخل ایجاد نماید
در صورتی که ناحیه مربوطه کامال از توالی های تشکیل شده باشد میتوان از
بروز این مشکل جلوگیری کرد
حضور پپتیدها ی باکتریایی در ایتدای پروتئین فیوژن پایداری آنها افزایش میابد و
از تخریب آن توسط میزبان جلوگیری میشود
مزایای سیستم الحاق
حضور پپتید باکتریایی میتواند یک سیگنال پپتیدی را که مسئول هدایت پروتئین E.COLIبه موقعیت صحیح آن در سلول
میباشد هدایت کند
اگر سیگنالهای پپتید از یک پروتئین ترشحت ژن های ی بدست می آید بطور مثال محصوالت COP Aیا COP Eپروتئینی
نوترکیب به درون محیط کشت یا فضای پری پالسمی بین غشا درونی و بیرونی سلول E,COLIترشح میشود ترشح
پروتئین یک مزیت محسوب میشود پرا که خالص سازی پروتیئن نوترکیب از محیط کشت را اسان میکند
هم چنین قسمت باکتریایی میتواند از طریق اماکن پذیر نبودن بازیافت پروتئین به وسیله کروماتوگرفای تمایلی در خالص
سازی کمک کند
حضور قطعه ای از پروتئین e,coliممکن است خصوصیات پروتئین نوترکیب را تغییر دهد
انزیم ترومبین
فاکتورxa
توجه :توالی های مورد شناسایی برای مواد برش دهنده نباید درون پروتئین نوترکیب قرارگیرند
مشکالت ناشی از توالی ژن خارجی
وجود توالی
وجود کدون های خاتمه در
های نامطلوب
ژن خارجی
مشکالت ناشی از وکتور E.COLI
مشکالت ایجاد شده توسط E.Coli
-2تاخوردگی
-1
-3تشخیص نادرست
گلیکوزیالسیون
اشتباه پروتئین پروتئین و
نادرست
و تخریب آن تشکیل
پروتئین
انکلوزیون
انکلوزیون
تولید پروتئین نوترکیب در سلول های
یوکاریوتی
• مشکالت ایجاد شده توسط E.Coliمحققان را برآن داشت تا جایگزین های
باکتریایی دیگر برای میزبانی پیدا کنند
• Lactocucus Lactis
• Pseudomonas
• مخمرها و قارچ ها
پروتئین های نوترکیب ناشی از مخمر
• ساکارومیسز سرویزیه :
رایج ترین یوکاریوت میکروبی برای تولید پروتئین های نوترکیب
که بواسطه پرومتور های بیانی زیر فعالیت میکند
-1پروموتر GAL
-2پروموتر AOX
-3پروموتر گلکوآمیالز
-4پروموتر سلوبیوهیدروالز
مخمرهای میزبان
در این روش ژن مورد نظر در این پروموتر وارد میشود که در جاندار ترانس ژن
وارد میشود که معموال دام است
مزیت این روش این است که جاندار مورد نظر پستاندار است
که باعث میشود تخلیص پروتئین نوترکیب آسان تر انجام شود
محصوالت ناشی از تولید پروتئین در فراورده
های دامی
پروتئین نوترکیب در گیاهان
هواکشت •