Chapitre 2

Le dépistage des maladies

infectieuses animales

1
 2. La valeur des tests de dépistage
Valeurs intrinsèques
A. Notions de « vrais » et de « faux »
B. Les « vrais » infectés et indemnes
– Sensibilité (se)
» aptitude du test à fournir une réponse positive
chez un individu infecté
» proportion d’individus infectés fournissant une
réponse positive au test
– Spécificité (sp)
» aptitude du test à fournir une réponse négative
chez un individu indemne
» proportion d’individus indemnes fournissant
une réponse négative au test

2
  Tableau 2.4

VP
Se =
VP + FN

3
  Tableau 2.5

VN
Sp =
VN + FP

4
 Valeurs intrinsèques
(sensibilité « se » et spécificité « sp »)

 Ne dépendent pas de la prévalence de la maladie

 Varient en sens inverse, pour un même test :
– améliorer la se se fait au détriment de la sp
– améliorer la sp se fait au détriment de la se

5
 Figure 2.4

6
C. Les « vrais » positifs et négatifs

« valeur » du résultat
1. Valeur prédictive d’un résultat positif (VPP)
» probabilité qu’une réponse positive à un test de
dépistage corresponde à un individu infecté
» proportion des vrais positifs parmi l’ensemble
des réponses positives fournies par un test de
dépistage
VP
VPP =
VP + FP

7
 Tableau 2.7

8
– 2. Valeur prédictive d’un résultat négatif (VPN)
» probabilité qu’une réponse négative à un test
de dépistage corresponde à un individu
indemne
» proportion des vrais négatifs parmi
l’ensemble des réponses négatives fournies
par un test de dépistage

VN
VPN =
VN + FN

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Valeur prédictive d’un résultat positif
(« VPP »)
 dépend de la prévalence (p) de la maladie
 dépend de la sp du test
 évolution de la VPP
– p est élevée : VPP est élevée
– p diminue : (VP+FP) diminue, mais FP ne
diminue pas, donc VPP diminue fortement
– confiance très limitée d’un résultat positif en
milieu faiblement infecté
– amélioration : changer de test, avec une
meilleure sp (diminuer l’impact des FP)

10
 Figure 2.5

11
 Valeur prédictive d’un résultat positif
(« VPP »)
La confiance (VPP) que l’on peut accorder à un
résultat positif en milieu très infecté est élevée.

 Figure 2.6

12
Valeur prédictive d’un résultat négatif
(« VPN »)
 dépend de la prévalence (p) de la maladie
 dépend de la se du test
 évolution de la VPN
– p est faible : VPN est élevée
– p augmente : (VN+FN) diminue, mais FN
augmente, donc VPN diminue fortement
– plus la maladie est rare, plus la VPN est élevée
– amélioration : changer de test, avec une
meilleure se (diminuer l’impact des FN)

13
 Figure 2.7

14
Evaluation d’un ELISA de dépistage de l’antigénémie par le virus BVD

15
16
17
D. A ne pas confondre
1. Prévalence réelle et prévalence apparente

Prévalence réelle (Pr) : VP + FN

Pourcentage de prévalence réelle : VP + FN .100

N
Prévalence apparente (Pa) : VP + FP

Pourcentage de prévalence apparente : VP + FP .100

N

18
 Prévalenceréelle et apparente ont en commun les
VP. Par contre, elles diffèrent par les erreurs : FN et
FP
– Si sp et se sont voisines et le taux de Pr voisin de 50 %,
FP et FN sont proches et par conséquent, la prévalence
apparente sera proche de la prévalence réelle
– En zone faiblement infectée, FP > FN, la prévalence
apparente sera plus élevée que la prévalence réelle
Estimation de la prévalence réelle à partir de la prévalence
apparente :

Pr = Pa + (sp – 1) Pr : taux de prévalence réelle

Pa : Taux de prévalence apparente
se + sp -1

19
 Exemple : Se et Sp relatives

 Tableau 2.6

Se : 0,9
Sp : 0,97

Pr = 100/1000 = 0,1
Pr (calculée) = 0,12 + (0,97-1) = 0,1
Pa = 120/1000 = 0,12
0,9 + 0,97 - 1

20
  Figure 2.8

 Pour Pr = 0, Pa correspond à FP, soit (1 – sp), soit 0,05 pour une sp

de 0,95
 Pour Pr = 100, Pa est déterminée par la sensibilité du test soit 0,9
21
 Tableau 2.10

22
 2. Sensibilité et détectabilité

 Définition : détectabilité
– « aptitude d’un test à révéler de faibles quantités de la
substance recherchée (anticorps, virus) »
– Elle s’exprime par un « seuil de détection » qui est « la plus
faible concentration détectable par le test »
 La détectabilité est influencée par la se
 permet les comparaisons
– entre pays, entre laboratoires
– pour diverses techniques
– sérum de référence international

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 Comparaison des trois tests rapides
Enfer Prionics Platelia
Technique ELISA Western blot ELISA sandwich
chémoluminescence
Durée du test <4h 7-8 h < 24 h
Anticorps Polyclonal lapinisé Monoclonal (6H4) 2 monoclonaux
Sensibilité 100 % (IC95 : 99 %) 100 % (IC95 : 99 %) 100 % (IC95 : 99 %)
Spécificité 100 % (IC95 : 99,7 %) 100 % (IC95 : 99,7 %) 100 % (IC95 : 99,7 %)
Détectabilité 10-1,5 10-1 10-3
Protéinase K + + +
Masse - + -
moléculaire
Résultat Quantitatif Qualitatif Quantitatif
(chémoluminomètre) (électrophorèse) (lecteur ELISA)

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 3. Répétabilité et reproductibilité

 La variabilité des réponses obtenues peut s’exprimer même dans les

conditions les plus semblables possibles. La variabilité des résultats
obtenus conduit aux notions de répétabilité et de reproductabilité.
 Définitions
– RÉPÉTABILITÉ : variabilité intra-observateur
» fidélité des résultats successifs obtenus par un même opérateur
travaillant dans un milieu donné avec le même appareil, la même
méthode, sur un produit identique

– REPRODUCTIBILITÉ : variabilité inter-observateurs

» fidélité des résultats obtenus par des opérateurs différents travaillant
dans des milieux différents, ou dans le même milieu, mais à des
époques différentes, avec la même méthode, sur un produit identique

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E. Valeur des tests à l’échelle du troupeau

En pathologie animale, l’unité épidémiologique est souvent

constituée par le troupeau.
Les résultats de dépistage à l’échelle du troupeau.

La sensibilité et la spécificité d’un test de dépistage n’ont pas les

mêmes valeurs selon que les résultats sont pris en compte de
manière isolée ou regroupée, pour l’ensemble des animaux du
troupeau

Au plan du troupeau, le dépistage peut se faire de deux

manières :
- Le test peut être appliqué sur un mélange de prélèvements
- Ou bien il peut s’agir de la somme de tests individuels

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 1. Sensibilité troupeau (« se troupeau »)

 définition :
– probabilité d’obtenir au moins un résultat positif dans un
cheptel infecté

 validité :
– test individuel appliqué à tous les animaux du cheptel

 troupeau avec un seul animal infecté :

– se troupeau = se individuelle

 troupeau avec >1 animal infecté :

– se troupeau > se individuelle

27
 Tableau 2.11

28
 Se individuelle relativement faible (90%), la
probabilité de détection d’infection du troupeau
devient très bonne dès lors que 2 animaux sont infectés :
se troupeau = 99%.

 En matière de sensibilité, le passage de l’échelle

individuelle à l’échelle troupeau est donc bénéfique

29
 Tableau 2.11b

30
 Lorsque l’on soumet seulement une partie des
animaux du troupeau au test, même avec un test
peu sensible, on peut arriver à une probabilité
élevée de détection de l’infection du troupeau
lorsque celui-ci comprend plusieurs animaux
infectés.
 Plus le nombre d’animaux infectés présents dans
le troupeau est élevé, plus la probabilité de
détection de l’infection du troupeau sera grande et
plus le nombre d’individus que l’on a besoin de
soumettre au test pourra être réduit.

31
 2. Spécificité troupeau (« Sp troupeau »)
 Définition :
– « probabilité de n’obtenir que des résultats négatifs dans
un cheptel indemne »
 Validité :
– test individuel appliqué à tous les animaux du cheptel
 Troupeau avec un seul animal infecté :
– sp troupeau = sp individuelle
 Troupeau avec >1 animal infecté :
– attention : sp troupeau < sp individuelle
Ex: 1 animal : Sp = 0,9
3 animaux : Sp =0,9³ = 0,73
– le « poids » des FP :

32
 Tableau 2.12

33
 - Sp individuelle = 0,9, effondrement
rapide de la spécificité troupeau :
» 34,9 % pour un troupeau de 10 animaux
» 0,5 % pour un troupeau de 50 animaux
Donc, 2/3 des troupeaux indemnes de 10
animaux seraient considérés comme infectés
et presque 100% des troupeaux indemnes de
50 animaux
- Un test de très bonne spécificité individuelle
fournirait, dans une zone de 1000 troupeaux
de 50 animaux indemnes une réponse
positive sur 1 animal dans 48 troupeaux.

34
 Ceci
doit conduire à une attitude de
prudence :
– tests de dépistage de spécificité limitée :
» Pr à partir de la Pa
calculée avec les « se et sp troupeau »
– interprétation de résultat positif unique dans un
troupeau soumis à dépistage, même avec un
test à bonne sp individuelle

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 3. Les valeurs prédictives de troupeau

 Elles se calculent avec la « se troupeau » et « sp

troupeau » (mode de calcul pas vu à ce cours)
 La VPP est d’autant plus élevée que la prévalence
de troupeaux infectés dans la zone est élevée.

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 3. Emploi des tests de dépistage
A. Les objectifs du dépistage
– Tests applicables à 3 niveaux différents :
» animal
» troupeau
» Zone (ensemble de troupeaux)
– Certitude de l’infection : l’infection d’un animal (troupeau)
peut être prouvée de façon incontestable
» résultats positifs à un test de dépistage
» Confirmation par méthodes directes de détection de
l’agent
– Preuve de l’indemnité envers la maladie : peut être
impossible (immunotolérance, infection récente)

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 Première démarche
– réponses positives
– détection et l’assainissement des troupeaux infectés
 Seconde démarche
– réponses négatives
– détection et qualification des troupeaux indemnes
– application de mesures de protection (maintien du
caractère indemne) et répétition du test de dépistage

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 1. Animal
 Première démarche :
– recherche des animaux infectés au sein d’un troupeau infecté,
– la sensibilité du test est à privilégier,
– on préfère éliminer les animaux positifs au test et prendre le
risque de FP plutôt que celui de FN
 Seconde démarche :
– Lors d’achat d’un animal en vue de son introduction dans un
troupeau indemne, le risque de FN doit être réduit au maximum.
– Pour avoir une VPN la plus élevée, le milieu d’origine doit être
indemne et le test de dépistage appliqué le plus sensible
possible, au détriment de la spécificité.
– Compléter le résultat négatif au test de dépistage par une
information fiable relative à l’absence de risque couru par
l’animal au cours de la période de temps écoulée qui correspond
à la durée maximale d’incubation

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 2. Troupeau
 Première démarche :
– reconnaissance de l’infection quel que soit son degré dans
le troupeau
» dépistage de tous les animaux
» ou utilisation d’un test collectif très sensible
– ou détection des troupeaux dont le taux d’animaux infectés
dépasse un certain seuil
» dépistage d’un échantillon
» ou utilisation d’un test moins sensible
 Deuxième démarche :
– qualification du troupeau.
– Les résultats négatifs d’un premier test de dépistage
doivent être confortés par au moins un autre ensemble de
résultats négatifs obtenus après un délai suffisant pour que
les sujets contaminés non détectés la première fois aient
réagi entre temps

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 3. Zone
 Première ou deuxième démarche
– informations sur la totalité des troupeaux
» dépistage exhaustif
» test de tous les animaux
– informations sur une partie des troupeaux
» sondage pour connaître le taux de cheptels
infectés dans la zone

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B. L’interprétation des résultats des tests de
dépistage

 But : déduire du résultat brut (positif ou

négatif), l’état de l’animal ou du troupeau vis à
vis de la maladie en tenant compte de sa
validité présumée (dépendant de l’objectif du
dépistage et des qualités extrinsèques du test)
et à la lumière de connaissances en biologie.

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 Interprétation d’un résultat positif
 1. Chez un animal
– VPP élevée quand p est élevée et sp est grande
– présence des facteurs de risque de la maladie
– risques d’interférence
» anticorps d’origine colostrale
» anticorps d’origine vaccinale
» communautés antigéniques
 2. Dans un troupeau, en plus
– intervention du nombre de résultats positifs et du
niveau de chaque réponse (sp troupeau)
– attention : réponse positive unique : conclusion
prudente

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 Interprétation d’un résultat négatif

 Chez un animal
– VPN élevée quand p est faible et se est élevée
– absence de facteurs de risque
» réponse négative après un délai à partir du
moment où il est à l’abri de tout risque de
contamination, égal au délai maximal d’apparition
du marqueur (anticorps)
 dans un troupeau
– VPN du troupeau est meilleure que VPN individuelle
– absence de facteurs de risque, à l’échelle du troupeau

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